在NCBI上怎么找到一个基因的外显子和内含子?

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在NCBI数据库中寻找基因的外显子和内含子,可以通过多种途径实现,其中一种方法是利用Splign工具。以下是具体的操作步骤:

首先,登录NCBI的Gene数据库,搜索你感兴趣的基因,例如HNF-4。在搜索框中输入基因的Symbol,也就是基因的名称。每个基因都有独特的Symbol,它会随着版本更新而变化,但GeneID始终不变,这在整个数据库中具有唯一性。

在搜索结果中,你可以查看HNF4基因的结构图,它会清晰地显示该基因有10个外显子,用蓝色标记的UTR区域分别位于5'端和3'端。UTR区域包含非编码序列,对基因的功能有一定影响。

接着,进入HNF-4基因的RefSeq区域,这里提供了该基因的参考序列,包括mRNA和基因组版本。通常,以NM_开头的序列是公认的参考序列。

为了找到外显子和内含子的具体序列,可以进入Splign的在线界面。你可以通过选择mRNA或基因组的Accession,或者直接输入Fasta格式的序列进行对比。记得,基因组序列可能较长,建议从预设的下拉框选项中选择常用的生物序列。

一旦进行比对,Splign会立即给出结果,包括10个外显子的详细位置,以及它们在mRNA序列中的对应区域。同时,UTR区的序列也会一并展示,这样你就可以全面了解该基因的结构和特性了。

一、外显子与内含子的区别:

1、是否为编码序列:内含子是断裂基因的非编码序列,可被转录。外显子是断裂基因中的编码序列。

2、在进化过程中的结果不同:内含子在mRNA加工过程中被剪切掉,故成熟mRNA上无内含子编码序列。外显子在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。

3、突变性不同:内含子对翻译产物的结构无意义,不受自然选择的压力,所以它比外显子累积有更多的突变。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列,所有的外显子一同组成了遗传信息,该信息会体现在蛋白质上,相对内含子稳定。

二、编码区与非编码区的区别:

1、是否能够转录信使RNA:编码区是指能够转录信使RNA的部分,它能够合成相应的蛋白质,而非编码区是不能够转录信使RNA的DNA结构。

2、组成不同:真核生物其中编码区是由外显子和内含子组成的,但是其中内含子又是非编码序列,所以说真核细胞基因结构中,非编码区和内含子是非编码序列 。外显子属于编码区。

扩展资料:

内含子起源有以下两种假说。

1.内含子与它所在的基因一样古老,在装配第一个这样的基因时,内含子就已存在。早期的内含子具有自催化、自我复制等能力,因此,它们是原始基因和基因组的组织与复制必不可少的部分。而今天的原核生物和少数低等的真核生物,由于它们需要进行快速的DNA复制从而进行快速的细胞分裂,因而失去了内含子。

现代的内含子是一类进化遗迹,它们之所以能继续存在,是因为具有重新组合基因组中的外显子以形成新的基因的能力,即内含子能赋予其携带者更大的进化潜力。

2.内含子不是基因原有的,而是在进化的某一过程中通过转座作用插入到连续基因中去的,内含子在较高级的功能基因或在真核生物出现之后才产生。这种假说必须面对一个难题,即内含子最初如何能插入到连续编码的基因中而保持基因的功能不变。

资料参考来源:

百度百科-非编码区

百度百科-编码区

百度百科-内含子

百度百科-外显子

关于“在NCBI上怎么找到一个基因的外显子和内含子?”这个话题的介绍,今天小编就给大家分享完了,如果对你有所帮助请保持对本站的关注!

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    9

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评论列表(4条)

  • 巩素红
    巩素红 2025年08月05日

    我是鸡脖创新的签约作者“巩素红”!

  • 巩素红
    巩素红 2025年08月05日

    希望本篇文章《在NCBI上怎么找到一个基因的外显子和内含子?》能对你有所帮助!

  • 巩素红
    巩素红 2025年08月05日

    本站[鸡脖创新]内容主要涵盖:生活百科,小常识,生活小窍门,知识分享

  • 巩素红
    巩素红 2025年08月05日

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